Cụ thể, có sự gia tăng cholesterol LDL (loại “xấu”) và giảm cholesterol HDL (loại “tốt”), tuy nhiên các nhà nghiên cứu vẫn chưa hoàn toàn biết rõ lý do tại sao những thay đổi trong cấu trúc lipid này lại xảy ra ở thời kỳ mãn kinh. Họ nghi ngờ rằng có “những yếu tố bảo vệ” ở phụ nữ tiền mãn kinh bị mất đi vào thời điểm này. Một thay đổi lớn xảy ra ở thời kỳ mãn kinh là sự suy giảm nồng độ estrogen: estrogen có khả năng giúp loại bỏ các hạt LDL và do đó mức LDL tăng lên khi lượng estrogen giảm.
Ngoài ra, hội chứng chuyển hóa (tập hợp các yếu tố nguy cơ của bệnh tim mạch bao gồm béo phì, tăng huyết áp, chuyển hóa glucose và lipid bất thường) lại trở nên phổ biến hơn nhiều sau khi mãn kinh. Tất cả các yếu tố này có liên quan đến tỷ lệ bệnh động mạch vành cao hơn.